一、个人概况
• 徐淑坦，男，上海海洋大学信息学院，数据科学与大数据技术专业，副教授。
• 在生物信息学顶会RECOMB，Computational and Structural Biotechnology Journal等杂志发表论文10余篇。
• 开发了多个生物信息学软件和生物大数据库，包括虚拟药物筛选软件modedock，癌症数据库tumorsurvival.org，海洋生物基因组数据库ogd.shou.edu.cn，单细胞测序数据库singlecell.ogd.shou.edu.cn等。
二、毕业院校及专业
吉林大学，计算机科学与技术，本硕博
三、海外学习经历
2015/09-2018/10，美国佐治亚大学，生物化学与分子生物系，博士后
四、研究方向
生物信息学，生物大数据挖掘
五、主讲课程
数据库原理与技术，数据挖掘，生物大数据
六、论文
(1) Shutan Xu; Yuan Feng; Shaying Zhao ; Proteins with Evolutionarily Hypervariable Domains are Associated with Immune Response and Better Survival of Basal-like Breast Cancer Patients, Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, 17: 430-440
(2) Shutan Xu; Shuxue Zou; Lincong Wang ; A Geometric Clustering Algorithm with Applications to Structural Data, Journal of computational biology, 2015, 22(5): 436-450
(3) Chen Cao; Shutan Xu ; Improving the performance of the PLB index for ligand-binding site prediction using dihedral angles and the solvent-accessible surface area, Scientific Reports, 2016, 6: 33232
(4) Shutan Xu; Yinhui Leng; Guofu Feng, Chenjing Zhang, Ming Chen ; A gene pathway enrichment method based on improved TF-IDF algorithm, Biochemistry and Biophysics Reports, 2023.06
七、学术著作与教材
陈明，张晨静，徐淑坦等. Python程序设计基础(普通高等教育农业农村部十三五规划教材)，中国农业出版社，ISBN：9787109290358，2022.01。
八、承担主要科研项目
1、纵向课题
[1]. 鱼类抗冻基因的生物信息学研究与数据库构建，上海海洋大学科技发展专项基金，主持，2021-2023年，经费10万
[2]. 南极鱼抗冻基因生物信息学研究与基因组数据库构建. 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室课题。主持，2021-2022年.
九、联系方式
电子邮箱：stxu@shou.edu.cn